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中国科学院“百人计划”a类 - 豆丁网
Web使用MEME-ChIP挖掘序列中的de novo motif. chip_seq数据库. ENCODE project项目简介. FactorBook:人和小鼠转录因子chip_seq数据库. ReMap:人类Chip-seq数据大全. IHEC:国 … http://wap.chinadhbio.com/Read/Read16_568.html i prevail worst part of me lyrics
MEME-ChIP - Submission form
WebChIP-Seq 是一种可以用来检测某个转录因子结合的 DNA 片段的技术,从而可以鉴定转录因子的结合位点。因此,可以利用 ChIP-Seq 实验来预测某个转录因子的靶基因。同时,还可以利用转录因子的结合位点序列信息,通过生物信息学分析方法来预测靶基因的转录因子。 WebIntroduction. In this vignette, we’ll explore using memes to deeply analyze a set of ChIP-seq peaks to identify motifs to explain differences in transcription factor binding, and consequences to chromatin accessibility at these ChIP peaks. We will use a dataset from (Nystrom, 2024) which investigated the binding of the transcription factor ... Web在基因组调控元件分析中,HOMER 可以用于发现新的motif。HOMER 通过比较两个序列集,再使用ZOOPS scoring (zero or one occurrence per sequence)和超几何检验进行富集分析。HOMER主要被用于 ChIP-Seq 和 promoter 分析,但是核酸序列motif寻找问题都可以尝试使用HOMER。 HOMER预测Motif 需要的两个序... i print and scan download